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          網絡藥理學原理及在中醫藥中的作用

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          網絡藥理學原理及在中醫藥中的作用

          中醫藥是中國優秀傳統文化的瑰寶,是數千年實踐經驗的集結,經過歷代醫家不斷的發展創新,取優棄粕,逐漸形成了系統的中醫藥理論及獨特的學術體系,在人類防病治病、維護健康中作出了巨大的貢獻,而“整體觀”、“辨證論治”和“個體診治”即是其精髓所在。隨著單靶點高選擇性的化學藥物在臨床應用上的毒副作用大、對復雜疾病的治療效果差等缺點,公眾“回歸自然”的呼聲越來越高,國際社會逐漸形成一股中醫藥熱[1?3]。但是由于中醫獨特的哲學思想與理論體系,很難被各國醫生及患者理解與接受。中藥及其復方具有多成分、多途徑、多靶點協同作用的特點,這種復雜性使得中藥藥效物質基礎不明確、作用機制不清楚、中藥和中藥材質量難以控制、缺乏科學合理有效的藥效和安全性評價體系,從整體到組織器官、細胞和分子水平都很難進行全面系統地研究[4]。這些大大限制了我國中醫藥的現代化和國際化的進程。但是近10年來,隨著現代基因組學、蛋白質組學、代謝組學等“組學”理論的發展,系統生物學視角的引入以及生物信息學的應用[5,6],網絡藥理學(networkpharmacology)概念應運而生,它是在系統生物學與計算機技術高速發展的基礎上發展起來的,基于“疾病?基因?靶點?藥物”相互作用網絡的基礎上,通過網絡分析,系統綜合地觀察藥物對疾病網絡的干預與影響,揭示多分子藥物協同作用于人體的奧秘[7],這與中醫學從整體的角度去診治疾病的理論,中藥及其復方的多成分、多途徑、多靶點協同作用的原理殊途同歸,無疑為跨越中西醫間的鴻溝架起了橋梁,為中醫藥的現代化和國際化指明了方向。

          1中醫藥現代化面臨的機遇與挑戰

          生物醫學發展至今,各項理論和技術日新月異,傳統的中醫藥必須加緊現代化的步伐,與時俱進,才能有更廣闊的發展空間。從以下幾方面闡述現階段中醫藥現代化面臨的機遇和挑戰。

          1.1人類疾病譜發生了變化隨著人類物質文明的高度發展,生活方式的改變,以及老齡化進程的加劇,以腫瘤、心血管疾病和糖尿病等為代表的慢性病已替代感染性疾病成為影響人類健康的重要因素。這類復雜性疾病是多基因、多步驟作用的結果。對這些疾病的治療,單靶點高選擇性藥物顯示出了治療效果差、副作用大等弊端。而在診斷上注重整體的和功能的動態變化,治療上強調辨證論治,力求從整體水平上調控機體,從而治療局部性病變和恢復整體功能平衡的傳統中醫藥學顯示出了良好的治療效果[8]。

          1.2新藥研發陷入困境自從PaulEhrlich在20世紀初提出“化合物受體存在”的學說后,期望設計能與疾病發生發展過程中的關鍵靶標高度特異結合的“魔術子彈”(magicbullet),成為現代藥物發現的核心問題[9]。在過去的30年中“一藥,一靶,一病”還原論方法加速了藥物發現的步伐,取得了突出的成果。然而,其效率低、速度慢以及成功率低的缺點也逐漸的顯露出來,特別是研發費用大而產出率低,二者之間不成比例。許多候選化合物難以全面、系統地反映藥物與疾病的相關性,往往在臨床前期和臨床試驗中,因低效或無效、藥物動力學較差、急性或亞慢性毒副作用等問題而被迫退出研發[10]。新藥研發正面臨著巨大困難,單靶點高選擇性的新藥研發思想到了“瓶頸期”,顯示出了其發展的局限性。系統生物學的研究揭示了藥物發揮作用的網絡特點,表明與單靶點藥物相比,多靶點藥物可能會有更好的臨床療效和較小的毒副作用。而中藥及其復方發揮療效具有整體性、多成分和多靶點協同作用的特點[11],勢必是未來國際上新藥研發的方向。

          1.3中醫藥現代化研究現狀肖培根院士2005年發表了“21世紀中藥研究的進展方向”文章,指出中藥的現代化是指將傳統中藥的特色優勢與最新的現代化科學技術密切結合,明確中藥及其復方在體內作用的物質基礎及藥理作用機制,使藥材質量達到穩定可控,能夠開發出具有中醫藥特色的治療復雜疾病的新藥[12]。目前科研人員常采用活性追蹤分離法從中藥中篩選活性化合物,但往往分離到的物質越純,其藥效活性越弱,難以追蹤到藥效物質。在整體觀和辨證論治理論的指導下,中藥及其復方發揮療效通常取決于其中的有效成分群的綜合作用[13],但是由于中醫理論現代化的研究滯后,以及中藥作用整體性、中藥成分復雜性和作用機制的多途徑、多靶點,使得中藥有效成分群難以識別,中藥藥效物質基礎不明確、作用機制不清楚,中醫理論指導下的新藥發現與設計進展緩慢,甚至趨于空白,成為制約中藥現代化、國際化和產業化進程的瓶頸。因此尋找符合中醫理法方藥理論,遵循中藥復雜體系、多途徑、多靶點的作用特點,建立與之相關的研究方法和關鍵技術,必將是科學研究中醫、合理應用中藥、復方推陳出新的關鍵科學問題。

          2網絡藥理學中醫藥現代化是形式所迫、大勢所趨,尋找適合中醫藥體系研究的模式和方法是中醫藥現代化發展的關鍵。現階段興起的網絡藥理學對于中醫藥現代化研究來說是一個很好的契機。

          2.1網絡藥理學概念的形成一直以來,新藥研發所遵循的基本原則是“對靶點的高選擇性”,認為藥物對靶點的選擇性越高,效果就越好,而副作用就越少。然而近幾年這一基本思路受到越來越大的挑戰。近20年來新藥開發的成功率越來越低,而臨床淘汰率卻越來越高,究其原因可能并不僅僅是技術、環境和投入的問題,更重要的可能是新藥開發的策略所致,即“一個基因,一種疾病,一個藥物”的原則在像癌癥這樣的多基因疾病領域的藥物開發中可能并不適用。系統生物學和生物途徑及相互作用網絡分析表明,生物系統的穩定性源于生物系統的網絡結構具有魯棒性(robustness)特征。這一網絡里的某一節點(蛋白)的改變并不總是能使表型發生很大的變化,這種表型的穩定性可以理解為與基因冗余功能和信號通路的代償有關。多數情況下,疾病發生的分子機制就是細胞內的調控網絡異常所致[14,15],所以對網絡內某個成員的高選擇性的藥物并不能使控制疾病的網絡癱瘓。現階段對疾病分子機制的認識與傳統的中醫證候理念不謀而合。數十年的中醫證候現代研究表明:證候是由許多因素組成的復雜系統,難以用單一的生理生化指標來表達。中醫證候與生物網絡的調節機制具有關聯性[16]。隨著對生物網絡認識的逐步深入,新藥研發有了新的策略:多靶點藥物的開發。如何尋找高效的多靶點藥物,發揮藥物最大的臨床療效,將副反應和毒性降到最低?在這個過程中產生了一種更具體、更有操作性的概念—網絡藥理學。網絡藥理學的概念由AndrewLHopkins于2007年首次在NatureBiotechnology上撰文明確[6],2008年在NatureChemicalBiology進一步發表了“網絡藥理學:藥物研發中的下一個研究范式”的綜述文章[5]。網絡藥理學是在系統生物學和多向藥理學快速發展的基礎上提出的藥物設計新方法和新策略,內容涵蓋各種組學、系統生物學、基因的連接性和冗余度以及基因的多效性、計算生物學和網絡生物學分析等。它在基于“疾病?基因?靶點?藥物”相互作用網絡的基礎上,通過分析基因網絡庫、蛋白網絡庫、疾病網絡庫、藥物網絡庫等現有數據庫的信息資料,結合從實驗中獲得的譜圖數據,利用專業網絡分析軟件及算法,系統的、整體的揭示疾病?疾病、疾病表型?靶點蛋白、靶點蛋白?藥物、藥物?藥物之間關聯的奧秘,從網絡的層面觀察藥物對疾病的干預與影響,揭示復雜藥物協同作用于人體的奧秘,從而找出高效低毒的多靶點新藥[17]。中醫理論具有系統觀與整體論的思想,雖然與網絡藥理學的理念不可簡單地相提并論,但它們有一點是共同的,也是非常重要的,即十分注重在整體條件下開展研究,同時十分注重在致病因素或者藥物干預下機體及網絡系統的整體反應,而不僅僅是觀察某些局部的病灶或表型改變[18]。同時,中藥復方是中醫防病治病的主要形式,具有多成分、多靶點、多途徑的特征,而這些特點正是網絡藥理學所要重點研究和期望達到的。

          2.2網絡藥理學發展的關鍵應用網絡藥理學指導新藥研發最關鍵的一步就是分析疾病網絡,鑒定疾病網絡中的關鍵節點。目前有3種互補的方法可以尋找調控網絡中的關鍵節點:系統篩選、知識挖掘和網絡分析。系統篩選指應用細胞篩選模型進行化合物組合、化合物與基因組合等的篩選方法。單獨的化合物可能只針對某一節點,而兩種(或以上)的組合能產生協同作用,可能針對的就是整個網絡。化合物與基因組合也是方法之一,首先使某個基因表達沉默,在此條件下再加入一種化合物,這樣聯合作用的結果對病變細胞會產生單一手段達不到的作用,例如對病變細胞的協同致死性。實際上,這種篩選方法在尋找關鍵節點的同時也找到了干預節點的多靶點藥物組合,效果很好,然而工作量很大。知識挖掘和網絡分析是首先應用計算機進行計算篩選以尋找最有可能的節點,之后再進行實驗驗證。知識挖掘是用提取數據、挖掘文本等方法對文獻數據庫、疾病數據庫、基因數據庫等進行關聯,并從中提取出疾病網絡(基因作用網絡、蛋白作用網絡)。當然這只是一種初步分析,提取的網絡還需要實驗驗證。中醫藥發展至今,積累了大量的數據和信息,現階段已有各種中醫藥數據庫搜索系統,從這些已有的數據中挖掘關鍵信息、重要信息,發現中醫藥證候方劑的復雜網絡特征及現代醫學本質是一項重要的研究內容。國內學者通過開發多種算法,探尋方劑復雜化學體系和機體復雜生物系統的關聯性,并取得了較大進展[19]。網絡分析即拓撲分析,也就是分析相互作用的網絡,從中找出關鍵節點。例如某一節點的分支越多,某節點與其他節點的路徑越短,那么這一節點可能就越關鍵[6]。常用的網絡拓撲特征有度(degree)、聚類系數(clusteringcoefficient)、最短距離(shortestpath)、介數(betweenness)等[20]。中醫藥從證候到方劑均體現了復雜網絡的特質。中醫辨證論治的原則是藥證相應,在處方用藥中存在君藥對主證,臣藥和佐藥對兼證的關系;主證、君藥類似于網絡的少數關鍵的集散節點,治則治法是這種復雜網絡關系的抽象概括,用現代生物信息方法對中醫藥復雜體系的網絡分析,有助于探索中醫證候—治法—中藥的關聯[21]。

          3網絡藥理學與中醫藥現代化的結合及應用

          中醫治療以整體觀、辨證論治為指導原則,具有“君、臣、佐、使”配伍原則的中藥復方則為臨床防病、治病的主要形式[22]。網絡藥理學本著整體性和動態性的特點,倡導多靶點、多途徑的給藥原則。因此,在中醫藥現代化進程中,一些中醫藥研究者借鑒網絡藥理學的研究思路,探索中醫藥“病證方”的本質屬性,揭示中藥及其復方多途徑、多靶點、多成分的綜合整體效應[23?26],并取得了良好的階段性成果。

          3.1網絡藥理學與中醫證候生物學基礎研究中醫學的基本特點在于整體觀和辯證論治,以病證結合、方證相應,即“病證方”結合的診療模式為特色。證候是中醫學整體觀、辨證論治、復方干預這一特色診療體系的核心內容。辨證論治與對“癥”治療的區別在于前者治療時針對體現整體變化的“證”,后者則針對癥狀,頭痛醫頭,腳痛醫腳。在認識層次上后者較淺,屬于感性認識;前者較深,有從感性認識上升到理性認識的飛躍,是深入到事物內部規律的認識階段。闡明證候的生物學基礎是中醫藥現代化的關鍵之一。數十年的證候現代研究表明:證候是由許多因素組成的復雜系統,難以用單一的生理、生化指標來表達。因此,隨著研究深度和復雜性的增加,需開辟一條適合于從復雜系統中發掘中醫證候特征的途徑[27]。網絡藥理學融合“疾病?表型?基因?藥物”的信息,從系統的、網絡的角度理解疾病表型與生命大分子的關系,其對“疾病表型?生物分子”網絡構建的思路能用于指導中醫藥證候生物學基礎的研究[28]。國內一些研究者利用網絡藥理學的方法,從生物分子網絡角度針對證候的生物學基礎展開研究,形成了適用于闡釋病證方系統內涵的“表型網絡?生物分子網絡?藥物網絡”研究構架,并進一步提出了“證候生物分子網絡標志”的構想,并構建了基于神經?內分泌?免疫(NEI)的寒證、熱證生物分子網絡,通過網絡功能分析,發現寒證生物分子網絡以激素的功能模塊為主,熱證的生物分子網絡以細胞因子的功能模塊為主,神經遞質功能模塊共同分布于兩個網絡。同時,通過網絡拓撲結構分析,發現寒熱證生物分子網絡具有無標度(scale-free)性質,即網絡的功能實現主要依賴于一些關鍵節點,這些關鍵節點可視作寒證、熱證的生物分子網絡標志。最后,他們還分析了證候分子網絡標志應用于證候客觀化與個體化診療、中醫藥臨床效果評價、方劑與中藥藥性等研究領域的可能性,為證候生物學基礎研究提供了一種新思路[29?31]。

          3.2網絡藥理學與中藥藥效物質基礎的研究中藥藥效物質是指中藥及復方中發揮藥理作用的化學成分體系,是中藥質量控制的基礎,也是中藥現代化的核心。中藥藥效物質基礎難以歸結為某一特定的有效化學成分,其作用機制也并非作用于某一特異性靶點,而是多成分通過多靶點、多環節整體調節作用的結果。成分間、靶點間、環節間客觀存在著密切聯系、相互協同與制約的復雜網絡。在網絡藥理學中,基于藥物與藥物之間在結構、功效等方面的相似性,可以構建藥物?藥物網絡,對藥物進行功效預測及對功效進行化學成分的預測。網絡藥理學的這種方法也能應用到中藥有效成分的功效預測及藥效物質化學組分分析。基于中藥藥效物質的網絡屬性,李梢等[28]利用網絡靶標的方法,從方劑中預測有效成分或組合。以腫瘤血管新生的干預為例,他們利用互信息熵等信息從3685首絡病方劑中提取了中藥核心配伍網絡,并從網絡中預測出多種成分的抗血管新生作用,并進一步證實這些成分均能有效作用于腫瘤血管新生的分子網絡。王耘等[32]整合已有的中藥藥效物質,并利用細胞信號通路數據庫、代謝網絡數據庫和基因調控網絡數據庫等構建了中藥功效分子網絡,該復雜網絡從分子層次上揭示中藥藥效物質基礎,網絡節點表示中藥化學成分和機體內源性成分,網絡的邊表示基于生物化學反應的各成分間相互作用關系。這些研究從網絡的角度預測、理解和闡明中藥的藥效物質,對于中藥藥效物質基礎的深入研究給予了很好的借鑒和啟示。

          3.3網絡藥理學與中藥方劑配伍理論的研究中藥復方是中藥防病治病的主要形式,是在中醫辨證施治的理論指導下,根據病機和藥性理論等,按照君、臣、佐、使等原則配伍組成的具有特定主治功效的藥方。中醫關于方劑的配伍有高度的科學性,中藥復方蘊含了中醫理論豐富、深刻而復雜的科學內涵。闡明中醫方劑配伍理論和規律是中醫藥現代化最具挑戰的研究之一。中藥復方這些多成分、多靶點、多途徑的特征,正是網絡藥理學所要重點研究的。李梢等采用網絡藥理學的研究方法,通過對構建的草藥網絡組成以及聯合模塊的分析來剖析傳統中藥方劑配伍的規律,他們建立了一個以距離為基礎的交互信息模型(distance-basedmutualinformationmodel,DMIM),用來辨別眾多藥方中有價值的草藥聯系。該模型以聯合交互信息的平均信息量以及草藥的間距等數值來評價中藥之間的相互作用及構建草藥網絡。DMIM被用于檢索草藥配對時,在草藥的出現次數、獨立性以及在藥方中的距離上能夠達到一個很好的平衡。通過DMIM他們利用3865個有關聯的藥方構建了草藥網絡,很好的解釋了傳統的草藥配對及配伍現象,同時還發現了新的具有協同和拮抗作用的藥物配對。另外,他們以網絡式的六味地黃(LWDH)藥方為例,提出了一個新穎的概念:聯合模塊,通過草藥?活性分子?疾病的多層網絡去探討具有可能性的藥方配伍機制。而且,在對LWDH藥方和LWDH治療的疾病表型分析中發現,LWDH治療的疾病顯示出表型高度一致性,而且這些聯合模塊在腫瘤路徑和神經-內分泌-免疫路徑中表現顯著,這也許可以解釋用相同的LWDH方劑治療不同疾病(異病同治)的行為[33]。張培等[34]以中藥藥性中的五味為研究對象,基于中藥飲片的現代藥理和臨床數據建立了苦味、辛味和甘味3個貝葉斯網絡模型,并利用所構建的網絡模型預測了部分中藥組分的五味,為中藥方劑組分配伍的研究提供了重要的支撐。中藥方劑中藥物配伍的權重分布具有無標度網絡特點,劉紅等[35]對具有一定代表性和覆蓋度的名老中醫共性處方配伍進行了網絡分析研究,并在此基礎上開發了中醫臨床數據挖掘復雜網絡分析軟件,能直接利用中醫臨床數據庫的數據進行復雜網絡建模和分析,從中發現臨床藥物配伍規律。

          3.4網絡藥理學與中藥藥理學作用機制的研究中醫藥現代化的研究離不開對中藥作用機制和作用規律的揭示。中藥復方的療效是由其組成的各種藥效物質之間及其與機體大分子之間相互作用的結果。中藥及其復方的多成分決定了其作用的多靶點和多環節,不同組分對不同環節起作用,最終表現出有利于機體的變化。網絡藥理學是研究多靶點干預疾病網絡,達到理想藥物療效的理論[36]。所以網絡藥理學的給藥思路和中藥的復方給藥本質殊途同歸,網絡藥理學的技術方法能很好的應用于中藥作用機制的研究。比如徐筱杰等[37]利用網絡藥理學的手段,運用分子對接和復雜網絡分析技術研究治療慢性腎病中藥所含化學成分和靶標之間的相互作用。結果顯示治療慢性腎病中藥所含化學成分-靶標相互作用網絡與西藥的化學成分-靶標相互作用網絡存在較大的差異,這說明中藥的作用機制和西藥的作用機制不完全相同。研究還發現補益類中藥所含化學成分-靶標相互作用網絡與攻逐類中藥所含化學成分-靶標相互作用網絡也存在較大差異,這從復雜網絡研究視角闡釋了古老的中藥作用理論。結合網絡藥理學和計算藥理學方法,他們研究了中藥芪參益氣滴丸中所含的1729個化合物在化學空間的分布,結果表明大部分化合物具有較好的類藥性質。同時,利用分子對接方法,他們研究了這1729個化合物與26個心血管疾病相關的公認靶標的相互作用及它們在靶空間的分布,闡明了芪參益氣滴丸治療血管疾病的可能作用機制及活性分子[38]。另外,他們采用網絡藥理學方法結合分子相似性分析、化學空間、分子對接、生物網絡技術和藥代動力學性質預測等計算藥理學方法研究了中藥精制透骨消痛顆粒中514個化合物的藥理學機制。結果表明該復方所含化合物在化學結構上具有多樣性而且大部分化合物在化學空間上具有類藥性質;通過分析這514個化合物與35個骨性關節炎疾病相關的公認靶標的相互作用及它們在靶空間的分布,闡明了精制透骨消痛顆粒可能的作用機制,并發現了一些潛在的活性分子;通過分析藥物庫中骨性關節炎的藥物?靶點的作用網絡及精制透骨消痛顆粒中分子?靶點的作用網絡的異質性值、特征路徑長度等拓撲特征,揭示精制透骨消痛顆粒的多藥物、多靶點、多途徑分子作用機制,這些有助于理解中藥精制透骨消痛顆粒的復雜藥理作用機制[39]。

          3.5網絡藥理學與中藥方劑毒理學的研究安全性是藥品屬性的基本要素之一,中藥也不例外。中藥方劑毒理學是研究中藥及中藥復方用藥后對機體產生的不良反應。中藥現代化和國際化的客觀現實,使得中藥方劑毒理學的研究也顯得越來越重要。方劑產生毒性的原因很復雜,比如中藥本身具有毒性、對藥性及藥物有毒成分缺乏了解、方劑配伍不當等。現階段對于方劑毒理學的研究,主要是通過各種毒性試驗了解方劑對人體的不良反應,指導合理用藥。然而,目前常用中藥有數千種,加上草藥、民間藥、少數民族藥共計10000余種,而做過系統的化學及藥理學研究的品種不過300余種。可見,我們對中藥的藥性了解很少,對其毒性或配伍后的毒性認識更是膚淺。這主要是由于研究手段不多,研究技術薄弱造成。網絡藥理學站在整體的角度,全面的理解疾病的分子機制、藥物作用機制,使藥物在發揮治療疾病(針對疾病網絡的關鍵節點)的同時,最大限度的不干預機體正常的生物網絡。現階段,應用網絡藥理學研究中藥方劑毒性及副作用的報道不多。國內有學者基于網絡大規模預測致病基因、藥物靶標,提出了drugCIPHER方法,預測的藥物靶標譜包含了藥物靶標和脫靶效應,利用靶標譜的聚類特征可以發現藥物的副作用[40]。另外,周明眉等[41]基于代謝網絡的分析方法對含馬兜鈴酸的中草藥的腎毒性開展了研究,建立了整體、動態的藥物毒性評價方法。

          3.6網絡藥理學與中藥復方新藥的開發網絡藥理學從整體的、系統的角度去探索藥物?疾病的關聯性,發現生物網絡上的藥物靶標,明確藥物治療疾病的機制,其宗旨實質上是一種新藥研發的策略。采用網絡藥理學發現新藥的方法主要有兩種形式,一是“老藥新用”方式,二是通過挖掘網絡中的關鍵節點和功能模塊研發單分子多靶點藥物[42],或多分子多靶點的復方制劑[43]。中藥蘊含著巨大的新藥創制潛力,傳統方劑是發現多靶點藥物的不竭源泉。目前,基于中藥的藥物研發多將重點集中于中藥的活性成分。然而,中藥的功效往往不是單一成分作用的結果,而是由多種成分協同作用實現。按照中藥作用的基本特點,建立中藥藥效成分網絡、藥效成分靶點網絡、藥效成分證候網絡等,探討多成分、多靶點、多環節的調整整合與優化,將為基于中藥的藥物研發提供新的思路。如有實驗室論證了網絡靶標定性與定量分析方法用于大規模篩選協同式中藥成分組合的有效性[26],為基于網絡靶標開展組方用藥的理性設計提供了一定的基礎。圖1概括了網絡藥理學與中醫藥的相關性。網絡藥理學的重要任務包括表型/疾病網絡(phenotype/diseasenetwork)的構建及藥物?藥物網絡(drug-drugnetwork)的構建,并且找出二者之間的關聯,達到發現新藥、治療疾病的目的。中醫治療疾病的核心是方(formula)證(syndrome)對應。構建傳統中醫藥的證候分子網絡(TCMsyndromemolecularnetwork)類似于網絡藥理學中對表型/疾病網絡的構畫;中藥的藥效物質成分之間存在多樣的聯系與區別,也構成了一個復雜的網絡體系,類似于網絡藥理學中的藥物?藥物網絡。藥效物質(compound)作用于證候分子網絡中的藥物靶標或關鍵節點(drugtarget/essentialnode),通過特定的分子藥理學機制(pharmacologymechanism)發揮功效。在方與證之間,存在著中醫辨證論治(syndromedifferentiationandtreatment)的精髓,也蘊含著中藥方劑配伍/君、臣、佐、使(herbalformulacompatibility-monarch,minister,assistant,guide)的深刻內涵。

          4展望

          中醫藥是一門極為復雜的醫學科學體系,利用整體、辨證的思維模式和方法來認識和研究人體生理活動、發病機制、病理變化、治療策略與方法,以及療效評價等,而這種“模式”很難運用單因素或多種因素“加和”的微觀分析方法與手段加以闡明和表述,而網絡藥理學是一種較全面系統的研究技術,在方法學上具有整體、動態、分析于一體的特點,符合中醫整體觀與辯證論治的原則。因而,以網絡藥理學來分析研究中藥及其復方更加適合中醫藥的學術特點和實際,將會為解決現代中藥研究的熱點問題“如何建立客觀科學研究中藥復方的關鍵技術,建立體現自身中醫藥特點研究方法和評價體系”發揮巨大的作用,促使中醫藥科技的總體水平有極大提升。由于網絡藥理學剛剛起步,很多地方還需要完善,特別是與疾病相關的關鍵基因還需要進一步尋找,同時中醫證候相關基因表達譜難以確定,中藥的藥效成分群數據有待積累。但是隨著疾病和藥物基因組和蛋白質組的不斷積累,中藥化學組學的不斷挖掘,計算軟件和計算方法的發展,網絡藥理學也必將得到快速的發展,為中醫藥復雜體系的現代醫學詮釋提供新的工具。